Historia toczy się w 21 wieku w alternatywnej rzeczywistości, gdzie szogunat Tokugawy zachował władzę. W tym świecie rady uczniowskie mają za zadanie tłumienia buntów i bardziej rebelianckich uczniów. Muneakira Yagyuu, wraz z Jubei Yagyuu trafiają w sam środek walki pomiędzy Yukimura Sanada i Matabei Gotou, a obecnym samorządem, Sen Tokugawa i Hanzō Hattori.